In der nahen Zukunft werden Mutanten von Robotern gejagt. Professor X und Magneto verbünden sich und senden Wolverines Bewusstsein zurück in die Vergangenheit, in der er den jungen Professor X und den jungen Magneto dazu bewegen soll, zusammenzuarbeiten. Sie sollen ein Ereignis verhindern, das die Zukunft sowohl der Mutanten als auch der Menschheit bedroht.